進入二季，動畫分開了三個篇章：[幽靈子彈篇]、[聖劍篇]、[聖母聖詠篇]。開篇的[幽靈子彈篇]不改其GAL GAME主旨，桐人繼續收攬后宮“佳麗”。倒是之後的兩篇不再以桐人為主角串連的故事，反更見精彩讓觀眾欣喜的，更能刻畫出網絡遊戲世界的團隊合作以及探險精神，也反映出遊戲人物背後所隱藏着的種種無奈和悲傷。
在[幽靈子彈篇]中，桐人加入到新興的以槍彈元素為世界觀的GGO，遇見一個持有一支與其身材不搭配的女孩詩乃，傲嬌的角色性格反襯出現實中女孩的孤獨無力。而其實在GGO世界的相遇，讓桐人和女孩都面對過去自己內心所極力逃避的陰暗面，中間兩人在患難中所結下的羈絆情緣，著實是讓觀眾反感的，是否考慮過遠在另一個遊戲世界的亞絲娜，是否考慮過官配黨的觀看感受！所以一如一季時候進入ALO之後的[妖精之舞篇]，依然的那般讓觀眾不適應。
幸而之後的[聖劍篇]以小組多角色的角度來描繪一個RAID（團隊戰）的故事，不同人物所承擔團隊中的不同定位，有所呈現這戰鬥的戰略性以及冒險性。作為觀眾，竟然可恥地信息看到不同顏色頭髮的女主角們使用不同的魔法武器組合，儼然是擁有這麼一華麗后宮的喜悅。
而結尾的[聖母聖詠篇]則將動畫帶入沉重的情緒當中，遊戲當中活力四射的女劍神，結果卻是患有絕症的羸弱女孩，為了讓自己的存在不被忘記，而找到了亞絲娜和幾個病友攻略一個需要團隊級別才有能力挑戰的BOSS，只有這樣他們的名字才能記錄在石碑上而不是只記下他們的工會名字。而此篇除了女孩的故事外，也同樣是要講述釋放內心壓抑面對真實的主題訴求，亞絲娜和母親之間的矛盾在因為認識女孩之後才鼓起勇氣衝破當中的隔閡，了解母親內心的溫柔一面。
其實二季的SAO，總體來說跟一季差不多的水平，於觀眾而言是好壞參半的。畫面製作依舊延續A-1 Pictures那般的高質水準，人設在不免俗的有服務內容外但也精美優質的，尤其不同顏色頭髮的女角色們，看著也是相當賞心悅目呀！！
